でも、たしかに「北、無苦尼堂」「北、薬師原」と、「、」が入っているように見えますね。三十六番の不動堂も「南、不動堂」に見えます。

これについて、下町タイムス社の『江戸・東京札所事典』を確認したところ、次のように書いてありました。

番号／札所名／所在地
三四番／南寮／流山市南、西善院
三六番／不動堂／流山市南、道路沿い
三七番／北薬師原／流山市北小屋香取神社の先
四番／無苦尼堂／流山市北小屋、集会場

というように書いてありましたて、どうも北だの南だのは、南という土地にある不動堂、北小屋という土地の薬師原というような意味合いじゃないかと思われます。

『江戸・東京札所事典』は昭和の終わり頃に出版されたものですし、著者が調査したのはさらにもっと前のはずです。現在とは状況も違っていますし、古い本なので校正も甘く、情報の怪しい部分もあります。実際に出かけて現在の状況を記録するのは大事なのことだと思いますので（もう見てらっしゃらないかもしれませんが）、どうか頑張ってください。